numpyでfor-loopしながらpairwise distanceを計算すると非常に遅い． pairwise distanceはgram行列のカーネルにrbfを使った時に絶対に出てくるので，高速計算は必須要件． 比較 普通のfor-loop 行列計算ベースで一気に行う方法 numbaで比較する 環境 Ubuntu1…

こことここにinspireされてnumbaを試した． 結論から言うと超早い．ごりごりの数値計算をするなら絶対使うべき． Installation Ubuntu14.04でanacondaは使わない llvm3.5 / llvmlite sudo apt-get install -y llvm3.5* sudo apt-get install -y libedit-dev …